140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0106 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 356 aa  729    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  24.51 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  21.41 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  20.92 
 
 		 792 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 357 aa  89.7  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  23.98 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  20.4 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  20.8 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  19.78 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  20.35 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  21.73 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  20.67 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.07 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  20.34 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.71 
 
 		 1040 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  19.17 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  19.09 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  21.27 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 1111 aa  70.1  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  23.68 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  20.5 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  18.77 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 1061 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  19.67 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  19.67 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  26.19 
 
 		 1061 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  21.05 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  18.8 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 1153 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  19.01 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  18.94 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  18.78 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  19.18 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  20.45 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  20.77 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  22.18 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  33.93 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  18.68 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  20.2 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  20.58 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 434 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  20.26 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  21.27 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  17.39 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  21.19 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  20 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  17.88 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  21.65 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 1096 aa  52.8  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  19.32 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  19.41 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  19.03 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  19.57 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  19.03 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0838  putative permease, YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0265755  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  21.61 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.61 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  19.87 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  20.91 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  20.72 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  20.91 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  21.77 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  18.21 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  28.41 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  28.41 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  28.41 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  28.41 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  28.41 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  18.31 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  18.75 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  24.4 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  19.08 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.08 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  24.19 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>