145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1429 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 367 aa  733    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  38.5 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  40.61 
 
 		 359 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  36.67 
 
 		 358 aa  255  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  36.29 
 
 		 360 aa  252  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  34.9 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  38.12 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  35.91 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  37.22 
 
 		 357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  37.33 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.76 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  27.22 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  26.39 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.54 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  20.86 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.8 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  23.9 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.08 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.25 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.14 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  20.5 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 1111 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  20.05 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 		 1040 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  19.15 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  20.44 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.11 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  20.71 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  22.35 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  18.09 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  21.95 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0054  permease YjgP/YjgQ  21.83 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.08 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 1096 aa  59.3  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  19.11 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  19.46 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  23.24 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  19.95 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0046  hypothetical protein  20.91 
 
 		 402 aa  57  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  19.55 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  20.98 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  21.73 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  20.49 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  22.74 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  21.66 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.54 
 
 		 1061 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.8 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  21.22 
 
 		 1061 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  20.43 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  22.94 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  20.71 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  19.3 
 
 		 401 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  20.71 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  20.71 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  21.58 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  20.26 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  21.24 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  21 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  20.26 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  19.46 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  19.09 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  19.46 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  20.96 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  18.62 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  21.39 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  20.99 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  27.21 
 
 		 486 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  19.89 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  20.91 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  20 
 
 		 403 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  20.73 
 
 		 364 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 364 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  20.54 
 
 		 356 aa  49.7  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  22.9 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  22.33 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>