201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2176 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 402 aa  797    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  69.05 
 
 		 400 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  61.19 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  27.89 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.72 
 
 		 409 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.1 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.49 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.47 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 792 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  25.13 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  26.83 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  28.29 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  24.2 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.14 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  28.75 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  26.83 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  25.94 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  21.91 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  21.3 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  27.32 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  26.83 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  21.04 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  27.14 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.6 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.16 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.81 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  21.35 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  30.57 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.1 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  24.82 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.49 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  22.67 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  26.08 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  25.88 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.61 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.76 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  27.42 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  24.42 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  19.17 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  18.9 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  23.01 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.34 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.81 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  23.53 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  23.53 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  26.96 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  23.53 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  19.84 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  23.27 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.43 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.16 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  23.53 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  23.53 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.62 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  25.64 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  20.68 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  27.61 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  20.38 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  27.05 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  25.29 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  19.67 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  21.86 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  21.68 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  21.54 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  26.45 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  23.45 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  25.74 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>