235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0556 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 386 aa  764    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  78.07 
 
 		 389 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
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NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  77.9 
 
 		 389 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  77.9 
 
 		 389 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  72.54 
 
 		 388 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  76.14 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  42.25 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  41.78 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  41.81 
 
 		 388 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  41.5 
 
 		 389 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  40.95 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  38.28 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  37.76 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  38.02 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  35.96 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  36.71 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  34.23 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  32.77 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  32.09 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  31.28 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  31.23 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0687  hypothetical protein  31.23 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  31.13 
 
 		 393 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  32.07 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
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NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  31.07 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
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NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  31.1 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_2900  permease  27.66 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  33.62 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  28.33 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
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NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  26.72 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  26.52 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
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NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  28.66 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
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NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
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NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  27.41 
 
 		 418 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  30.49 
 
 		 371 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  30.16 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  29.84 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  26.88 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  28.01 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  27.21 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  28.14 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
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NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  26.49 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.38 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  27.7 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
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NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  24.49 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.76 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  25.55 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  21.79 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  22.66 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  26.45 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  30.2 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  27.34 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  25.16 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  23.62 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  25.27 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  25.99 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  26.71 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  29.1 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  22.17 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  27.92 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  26.52 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  27.41 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  24.6 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  24.6 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  24.6 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  24.6 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  24.6 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  22.58 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  26.58 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
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NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  24.43 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  24.28 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  23.15 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
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NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  25.61 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
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NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
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