181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2838 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 405 aa  810    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  42.25 
 
 		 386 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  44.04 
 
 		 389 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  43 
 
 		 389 aa  292  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  43 
 
 		 389 aa  292  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  44.95 
 
 		 388 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  43.43 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  39.54 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  39.69 
 
 		 389 aa  253  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  39.69 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  39.23 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  40.06 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  38.58 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  37.66 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  32.04 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  30.9 
 
 		 402 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  30.83 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  29.03 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  29.22 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  30.15 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  30.15 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  31.56 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  27.39 
 
 		 393 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  27.82 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  29.78 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  27.71 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  27.63 
 
 		 398 aa  133  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  27.79 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  29.31 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  28.53 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  32.85 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  30.33 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  30.33 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  26.62 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.43 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  26.54 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.8 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  29.44 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  27.38 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  29.44 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  27.91 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  28.97 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.52 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  28.92 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.57 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  31.22 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  23.02 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  26.48 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 792 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  29.47 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  26.03 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  28.31 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  27.62 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  29.8 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  25.16 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0593  permease-like protein  24.84 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.472296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  23.79 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  23.26 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  25.29 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  22.81 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  24.23 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  27.71 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  24.76 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  21.69 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  24.76 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  26.55 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.75 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  22.92 
 
 		 363 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  23.62 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  29.25 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  22.45 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  29.49 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>