64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0593 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0593  permease-like protein  100 
 
 		 386 aa  791    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.472296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0937  permease YjgP/YjgQ family protein  62.84 
 
 		 380 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0199625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  24.24 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.9 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.81 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  21 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  25.97 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  23.25 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  22.99 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  24.07 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  18.31 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  24.46 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 792 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  22.27 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.82 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  22.94 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.55 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  23.29 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  24.89 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  19.93 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  22.46 
 
 		 396 aa  49.7  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.11 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  22.41 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  21.99 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  21.84 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  22.06 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  18.15 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  23.7 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  21.47 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  22.79 
 
 		 370 aa  46.2  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  22.79 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  22.28 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  22.79 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  20.56 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  20.23 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  19.79 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  19.79 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  21.55 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  27.39 
 
 		 230 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  22.45 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  19.03 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  22.11 
 
 		 418 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  20.08 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>