204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1757 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 416 aa  847    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  48.45 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  45.72 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  44.53 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  45.45 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  48.08 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  45.78 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  46.04 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  42.48 
 
 		 396 aa  332  8e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  35.46 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  35.46 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  35.7 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  41.04 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  41.37 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  34.19 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  35.96 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  34.27 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  33.51 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  33.25 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  33.33 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  34.21 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  32.22 
 
 		 388 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  31.56 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  29.53 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  28.62 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  28.62 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  27.33 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 		 378 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  28.48 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  25.57 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  27.9 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  28.33 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.16 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.46 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  26.81 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  25.24 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.63 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  23.36 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.12 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  23.36 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.77 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  26.33 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.59 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  26.22 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.53 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  24.05 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  22.76 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  23.78 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  27.43 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.91 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  22.51 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  22.33 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  22.26 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.33 
 
 		 1061 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  24.41 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.33 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  22.09 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.33 
 
 		 1061 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  22.15 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  23.55 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  22.03 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.61 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  22.71 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.54 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  24.51 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  22.71 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  19.6 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.12 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 		 480 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  23.23 
 
 		 481 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 792 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  27.14 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  22.43 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.15 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>