186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1121 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2900  permease  90.69 
 
 		 376 aa  664    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  90.69 
 
 		 376 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 376 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  53.93 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  49.56 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  44.84 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  41.78 
 
 		 380 aa  265  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  29.85 
 
 		 388 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  28.65 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.43 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  27.86 
 
 		 378 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  29.28 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  27.23 
 
 		 389 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  27.23 
 
 		 389 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  27.8 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  27.63 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  26.02 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  27.08 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  27.33 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  27.08 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  26.48 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  24.07 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  26.48 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  25.9 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  24.83 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  26.36 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  24.49 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  28.12 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  30.39 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  26.95 
 
 		 361 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.75 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.47 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  27.14 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  21.68 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.53 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  31.54 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  21.58 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.56 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.44 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  29.03 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.26 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  23.2 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.11 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  31.65 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  31.65 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  27.76 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  27.61 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.48 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.22 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.12 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  23.48 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  25.15 
 
 		 401 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  20.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 792 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  25.17 
 
 		 651 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  31.33 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  29.45 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.46 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  21.73 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  28.03 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  20.8 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  29.11 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  21.73 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  25.8 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  21.48 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.03 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  20.71 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  27.95 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.41 
 
 		 370 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>