50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1263 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1263  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 342 aa  685    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000160031  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  80.7 
 
 		 342 aa  566  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0748  YjgP/YjgQ permease  54.68 
 
 		 341 aa  381  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  52.77 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  44.19 
 
 		 341 aa  308  9e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0913  hypothetical protein  46.18 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.17255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0843  hypothetical protein  46.18 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1188  hypothetical protein  45.59 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0525463  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1127  permease YjgP/YjgQ family protein  46.96 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  39.06 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  25.09 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.81 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.3 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  22.18 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  24.12 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  20.8 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.88 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 371 aa  49.7  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  22.5 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.54 
 
 		 792 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  20.78 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  24.09 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  21.59 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  21.05 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  21.59 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 378 aa  46.2  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  27.34 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  21 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  24.09 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  23.56 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  19.46 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  20.25 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  28.79 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  21.07 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.78 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  19.6 
 
 		 383 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  19.13 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  20.32 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  21.17 
 
 		 382 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  19.2 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  18.79 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 389 aa  42.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 389 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  24.77 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>