76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0972 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  100 
 
 		 340 aa  674    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0748  YjgP/YjgQ permease  57.56 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  54.23 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1263  permease YjgP/YjgQ  52.77 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000160031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  50.74 
 
 		 341 aa  332  8e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0913  hypothetical protein  43.53 
 
 		 341 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.17255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0843  hypothetical protein  43.53 
 
 		 341 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1188  hypothetical protein  43.24 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0525463  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1127  permease YjgP/YjgQ family protein  43.58 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  34.93 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.8 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 792 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  25.24 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  19.78 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  23.11 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.3 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  22.32 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.01 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  20.62 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  24.57 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  22.11 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  23.74 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  26.45 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  20.25 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.54 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  27.55 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  22.27 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  25.31 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  20.82 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  21.01 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  25 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  20.37 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  23.46 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  17.56 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  21.82 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.31 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  21.64 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  21.01 
 
 		 376 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  21.01 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  24.34 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  26.63 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  21.99 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  19.24 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  20.79 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  20.86 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.65 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  26.61 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.85 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  19.91 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  20.63 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  20.97 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 		 376 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  19.92 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>