83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0748 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0748  YjgP/YjgQ permease  100 
 
 		 341 aa  672    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  55.85 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  57.56 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1263  permease YjgP/YjgQ  54.68 
 
 		 342 aa  381  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000160031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  49.13 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0913  hypothetical protein  47.06 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.17255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0843  hypothetical protein  47.06 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1188  hypothetical protein  46.18 
 
 		 341 aa  293  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0525463  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1127  permease YjgP/YjgQ family protein  42.86 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  35.86 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.86 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  23.02 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  23.05 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  23.39 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  23.66 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.86 
 
 		 792 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  21.59 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  24.77 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  17.81 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  22.83 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  21.03 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 358 aa  53.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  20.55 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  21.24 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  22.67 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  23.61 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  21 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  22.22 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  19.14 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  22.56 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  21.27 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  25.66 
 
 		 384 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0366  permease YjgP/YjgQ family protein  24.91 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710908  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  21 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  21.23 
 
 		 366 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  22.22 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  23.08 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  21.24 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  22.62 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  20.82 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  19.53 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.1 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  22.9 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  19.88 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  20.64 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  17.82 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  21.85 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  22.51 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  22.81 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  21.34 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  19.42 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  20.77 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  22.81 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  20.77 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.03 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  27.44 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  20.29 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2200  YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.395164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1856  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  17.36 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  20.29 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  21.72 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.09 
 
 		 399 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  18.72 
 
 		 442 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  26.62 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  20.13 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>