108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0913 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0913  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  686    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.17255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0843  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  686    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1188  hypothetical protein  98.53 
 
 		 341 aa  676    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0525463  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  58.19 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1263  permease YjgP/YjgQ  46.18 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000160031  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0748  YjgP/YjgQ permease  47.06 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  47.06 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  43.53 
 
 		 340 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1127  permease YjgP/YjgQ family protein  42.27 
 
 		 341 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  34.2 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  25.95 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  23.29 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  25.32 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.73 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  23.33 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.05 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  24.31 
 
 		 389 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  22.12 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  23.62 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  24.1 
 
 		 388 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  23.08 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  20.26 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  31.11 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  22.78 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  20.28 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  23.4 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  20.28 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  19.7 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  24.47 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  23.42 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  20.28 
 
 		 371 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  22.12 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 792 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  21.66 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  21.63 
 
 		 388 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 367 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  25.11 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  17.76 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  23.11 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  23.01 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  24.24 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  21.09 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  22.66 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3736  permease YjgP/YjgQ family protein  22.66 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  22.66 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  22.66 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  22.66 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  22.66 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  22.66 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  22.66 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.85 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  27.73 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  27.73 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  23.86 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  23.86 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  23.86 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  21.97 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  23.86 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  23.86 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  23.86 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  23.86 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  20.53 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  20.93 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  26.89 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  20.63 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  20.51 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  20.51 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  20.51 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  20.51 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>