80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0995 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 339 aa  673    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1127  permease YjgP/YjgQ family protein  43.77 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  37.2 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1263  permease YjgP/YjgQ  39.06 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000160031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  35.6 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0748  YjgP/YjgQ permease  35.86 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  34.93 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0913  hypothetical protein  34.2 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.17255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0843  hypothetical protein  34.2 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1188  hypothetical protein  35.5 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0525463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  26.84 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  28.87 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  20.96 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  26.34 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  27.7 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.49 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.75 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  27.74 
 
 		 399 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  21.66 
 
 		 418 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.76 
 
 		 391 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0335  hypothetical protein  31.43 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 382 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1363  hypothetical protein  31.82 
 
 		 353 aa  49.3  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0358  hypothetical protein  31.43 
 
 		 352 aa  49.7  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  26.04 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 		 379 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  28.23 
 
 		 792 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1652  hypothetical protein  30.71 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000404268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  29.86 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  19.93 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  25.29 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  19.93 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  19.93 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  27.44 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  21.15 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  25.17 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0046  hypothetical protein  34.74 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  24.21 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0366  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  19.57 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  25 
 
 		 401 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  19.57 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 376 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  27.22 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  27.22 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  28.24 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  27.22 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  25.86 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.86 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  25.86 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  26.15 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  21.13 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.82 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  32 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.78 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  22.66 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.08 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  22.71 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0054  permease YjgP/YjgQ  31.25 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  20.3 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  20.3 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  23.55 
 
 		 388 aa  42.7  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  18.92 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  20.3 
 
 		 353 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 396 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>