More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04632 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04632  VanR  100 
 
 		 69 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 273 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  53.73 
 
 		 257 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 264 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  49.28 
 
 		 252 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  52.24 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  47.06 
 
 		 236 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  48.53 
 
 		 236 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 233 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 251 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 247 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 251 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 227 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  41.27 
 
 		 246 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 254 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 233 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 239 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 233 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 214 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 240 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 226 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 233 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 235 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  49.09 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 222 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 243 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 227 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  44.07 
 
 		 252 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 233 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 234 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 231 aa  50.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 230 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  39.71 
 
 		 263 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  40.98 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 239 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 219 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  41.27 
 
 		 263 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 255 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 239 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 260 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 250 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  42.37 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 230 aa  47.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  41.27 
 
 		 274 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>