238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59178 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_59178  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 990 aa  2030    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.55333 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05215  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07490)  25.12 
 
 		 1132 aa  238  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.75 
 
 		 792 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 1221 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  32.67 
 
 		 317 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.4 
 
 		 692 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.41 
 
 		 1856 aa  71.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.55 
 
 		 1523 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.11 
 
 		 1188 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.28 
 
 		 696 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  34.82 
 
 		 335 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.61 
 
 		 1363 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  30.46 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  30.6 
 
 		 928 aa  67.8  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.82 
 
 		 676 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13870  predicted protein  25.12 
 
 		 1107 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  36.08 
 
 		 1193 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.73 
 
 		 1868 aa  67  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  29.52 
 
 		 1190 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  32.23 
 
 		 1236 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.54 
 
 		 1807 aa  65.1  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 1686 aa  65.1  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.63 
 
 		 947 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1190 aa  65.1  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42932  predicted protein  31.51 
 
 		 1193 aa  65.1  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.17 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.27 
 
 		 1557 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30 
 
 		 1652 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1196 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  27.86 
 
 		 439 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.98 
 
 		 698 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 		 316 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  22.38 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  34.34 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.78 
 
 		 1267 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.89 
 
 		 1760 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.62 
 
 		 1364 aa  62  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  29.33 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  30.08 
 
 		 1454 aa  61.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  28.93 
 
 		 316 aa  60.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  30.3 
 
 		 578 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  27.75 
 
 		 618 aa  60.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.824291 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05517  cell division control protein Cdc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13030)  24.71 
 
 		 1038 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  31 
 
 		 1552 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  30.7 
 
 		 657 aa  60.1  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  29.66 
 
 		 826 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  35.14 
 
 		 316 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.32 
 
 		 1831 aa  59.7  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1176 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.74 
 
 		 1240 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.04 
 
 		 1348 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.91 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.27 
 
 		 1247 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  31.61 
 
 		 1177 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  31.21 
 
 		 1164 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  31.13 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 		 1213 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.95 
 
 		 1039 aa  58.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  28.95 
 
 		 1041 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.71 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  33.66 
 
 		 577 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 342 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1474 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.27 
 
 		 1163 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  22.41 
 
 		 922 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1208 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  23.81 
 
 		 473 aa  56.6  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1214 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.47 
 
 		 1823 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1477 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67807  F box protein, for ubiquitin- dependent degradation  24.78 
 
 		 780 aa  56.6  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  28.83 
 
 		 464 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.35 
 
 		 344 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  25.64 
 
 		 756 aa  56.2  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  30.7 
 
 		 774 aa  56.2  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  27.27 
 
 		 840 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.25 
 
 		 1901 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  31 
 
 		 1789 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 		 1161 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 		 1161 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.3 
 
 		 642 aa  55.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.94 
 
 		 574 aa  55.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  31.07 
 
 		 521 aa  55.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.01 
 
 		 1262 aa  55.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.68 
 
 		 1443 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 		 1711 aa  55.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.79 
 
 		 919 aa  55.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.68 
 
 		 1211 aa  55.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.1 
 
 		 505 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  30.63 
 
 		 772 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  28.95 
 
 		 1204 aa  54.7  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  30.63 
 
 		 772 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  31.07 
 
 		 1205 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11703  predicted protein  28.24 
 
 		 820 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  21.08 
 
 		 1344 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  27.27 
 
 		 564 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  29.41 
 
 		 589 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.61 
 
 		 1188 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>