More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15922 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_15922  predicted protein  100 
 
 		 102 aa  212  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00347637  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_16021  predicted protein  89.11 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.521633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  51.55 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  49 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  52.63 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  50.51 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  50.53 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  45.54 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  45.54 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  52.63 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  52.63 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  50.52 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 158 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  49.49 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  48.48 
 
 		 166 aa  88.6  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  47.96 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  48.42 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  48.42 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  45.1 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  46.08 
 
 		 158 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1576  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  48 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  49.5 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  44.55 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  47.47 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  44.55 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  44.55 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  45.54 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  43.14 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1060  SsrA-binding protein  41 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  42.16 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  40.59 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  44.55 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  45.92 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  43 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  43 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  45.1 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  41.18 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  43.56 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  43.56 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  40.59 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  36.63 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  41.58 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  43.56 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  36.63 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  41.58 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  41.58 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  37.62 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  40.59 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  40 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  36 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  44.55 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  44.55 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1111  SsrA-binding protein  39 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  44.12 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  41 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  40.59 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  44.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  41.58 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4169  SsrA-binding protein  39 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.496394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  44.55 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  42 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  43 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  43.56 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 157 aa  72  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  43.27 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  41.18 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  42.72 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  40.59 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  41.67 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0096  SsrA-binding protein  37.62 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  42.16 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  41.58 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  41 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  38.61 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  40 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  40 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  41.05 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  37.62 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  43.56 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  40.2 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  42.16 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  39.6 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  43.3 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2057  SsrA-binding protein  42 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00464392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>