More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1193 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  100 
 
 		 165 aa  330  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  98.79 
 
 		 165 aa  326  7e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  69.33 
 
 		 166 aa  221  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  68.92 
 
 		 166 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  64.24 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  60.84 
 
 		 167 aa  213  7e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  65.07 
 
 		 165 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  57.93 
 
 		 164 aa  196  9e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  57.93 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  57.32 
 
 		 164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  58.11 
 
 		 154 aa  194  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  55.33 
 
 		 155 aa  181  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 155 aa  177  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  43.95 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  42.48 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  46.01 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1239  SsrA-binding protein  44.85 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  51.16 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  45.91 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  43.62 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  40 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1282  SsrA-binding protein  42.42 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0727299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  40.61 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  40.82 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  42.76 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1094  SsrA-binding protein  44.38 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.146996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  43.92 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  49.23 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  49.23 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  41.82 
 
 		 167 aa  131  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 155 aa  131  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1473  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2854  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  43.9 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  43.92 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2776  SsrA-binding protein  42.31 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2952  SsrA-binding protein  42.31 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  40.85 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  41.46 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2388  SsrA-binding protein  39.63 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  41.38 
 
 		 155 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  39.26 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  43.45 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  42.76 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  39.47 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  41.96 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  41.33 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1576  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  46.46 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  42.68 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1520  SsrA-binding protein  41.38 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0417834  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2479  SsrA-binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0209136  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  42.28 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  41.5 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>