More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1927 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  316  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  96.18 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  91.72 
 
 		 157 aa  295  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  89.81 
 
 		 157 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  89.17 
 
 		 157 aa  289  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  87.9 
 
 		 157 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  85.99 
 
 		 157 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  71.07 
 
 		 159 aa  228  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  71.07 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  70.7 
 
 		 158 aa  224  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  67.72 
 
 		 158 aa  224  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  67.1 
 
 		 158 aa  219  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  67.53 
 
 		 158 aa  218  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  68.92 
 
 		 160 aa  217  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  67.53 
 
 		 158 aa  216  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  66.89 
 
 		 158 aa  216  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  70.27 
 
 		 161 aa  215  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  72.33 
 
 		 159 aa  213  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  67.79 
 
 		 155 aa  213  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  64.94 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  64.86 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  66.22 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  67.52 
 
 		 157 aa  200  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  66.88 
 
 		 157 aa  197  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  66.24 
 
 		 157 aa  197  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  64.97 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  64.97 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  64.38 
 
 		 152 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  61.78 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  56.38 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  58.78 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  60 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 160 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  59.46 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  55.19 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  55.19 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  55.03 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  53.75 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 159 aa  167  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  54.67 
 
 		 157 aa  166  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  54.68 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  54.68 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  58.62 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  61.72 
 
 		 153 aa  163  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  54.19 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  50 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  52.56 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  51.97 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  50.96 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  52.6 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  52.6 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  52.6 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50.64 
 
 		 155 aa  154  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  51.95 
 
 		 160 aa  153  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  50.32 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  49.36 
 
 		 161 aa  150  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  51.33 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  50 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  55.88 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  55 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  50.96 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>