More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0117 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  100 
 
 		 166 aa  337  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  86.75 
 
 		 167 aa  283  9e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  80.72 
 
 		 165 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  74.68 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  64.46 
 
 		 165 aa  225  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  68.46 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  63.82 
 
 		 154 aa  212  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  60.61 
 
 		 164 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  59.39 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  63.76 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  63.19 
 
 		 164 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  61.9 
 
 		 155 aa  197  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  61.9 
 
 		 155 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  56.49 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  59.6 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  58.5 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  58.5 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  46 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  50 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  46.99 
 
 		 171 aa  147  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  53.12 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  51.16 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  48.32 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  50 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  51.77 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  52.63 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  46.71 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  44.74 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 150 aa  141  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 150 aa  141  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 156 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46.84 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  45.1 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  47.71 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  50.71 
 
 		 150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1239  SsrA-binding protein  46.71 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 154 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  45.03 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1272  SsrA-binding protein  45.16 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1282  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0727299  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1094  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.146996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  45.64 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  45.1 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  48.91 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 152 aa  134  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>