More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1033 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  100 
 
 		 154 aa  316  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  63.4 
 
 		 150 aa  190  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  58 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  58.5 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  58.5 
 
 		 158 aa  183  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  54.97 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  60.14 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  56.76 
 
 		 155 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  56.76 
 
 		 155 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  54 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  59.46 
 
 		 153 aa  177  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  57.93 
 
 		 154 aa  176  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  58.78 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  56.08 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  58.78 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  56 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  57.33 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  57.33 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  53.95 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 155 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  56.76 
 
 		 157 aa  171  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 172 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  52.6 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  52.98 
 
 		 157 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  54.97 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  54.25 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 150 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  56.08 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  52.63 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  52.67 
 
 		 154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  59.29 
 
 		 163 aa  163  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  58.57 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  58.57 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  50.99 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 164 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  51.33 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 164 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  57.97 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  49.34 
 
 		 159 aa  158  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  51.02 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  54.48 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 155 aa  157  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1198  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 189 aa  157  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 159 aa  156  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  54.35 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 177 aa  155  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1256  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0547561  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  54.36 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2552  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 161 aa  155  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  53.02 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  52.29 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>