More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3316 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  100 
 
 		 154 aa  317  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  65.1 
 
 		 151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  62.09 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  59.48 
 
 		 153 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  58 
 
 		 155 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  51.66 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  52 
 
 		 167 aa  170  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  53.9 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  53.29 
 
 		 155 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  54.97 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  53.29 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  52.6 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  50.99 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48.68 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 159 aa  160  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  54.35 
 
 		 161 aa  160  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  50 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  46.2 
 
 		 165 aa  157  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  46.84 
 
 		 165 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  48 
 
 		 159 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  54.9 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  54.9 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  48 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 171 aa  154  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 168 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 168 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 168 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  48.32 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 176 aa  154  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  49.35 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.32 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  50 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  48.05 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  53.02 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 177 aa  150  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 152 aa  150  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  51.77 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  49.32 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6841  SsrA-binding protein  48 
 
 		 162 aa  146  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  47.77 
 
 		 157 aa  146  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  53.57 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  51.75 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 177 aa  143  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 172 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  46.71 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 155 aa  140  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 175 aa  140  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1272  SsrA-binding protein  46.41 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  45.7 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>