More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0822 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  100 
 
 
154 aa  314  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  100 
 
 
154 aa  314  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  89.1 
 
 
156 aa  282  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  63.33 
 
 
155 aa  199  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  64.58 
 
 
155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  62.67 
 
 
155 aa  197  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  62.67 
 
 
155 aa  197  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  61.33 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  61.33 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  61.33 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  61.33 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  61.33 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  63.45 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  62.76 
 
 
155 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  62.07 
 
 
155 aa  192  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  60.69 
 
 
155 aa  189  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  60.78 
 
 
156 aa  189  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  60.78 
 
 
156 aa  189  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  58.17 
 
 
157 aa  184  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  58.62 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  56.58 
 
 
155 aa  181  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  58.62 
 
 
155 aa  179  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  59.03 
 
 
159 aa  178  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  56.43 
 
 
153 aa  177  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  59.03 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  57.64 
 
 
154 aa  177  7e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  55.94 
 
 
156 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  58.78 
 
 
151 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  56.94 
 
 
152 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  57.43 
 
 
154 aa  175  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  54.84 
 
 
157 aa  175  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
151 aa  175  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  55.56 
 
 
159 aa  175  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
161 aa  174  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  57.34 
 
 
155 aa  173  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  57.34 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  53.64 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  60.28 
 
 
160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  55.41 
 
 
158 aa  169  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  57.82 
 
 
158 aa  168  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  54.9 
 
 
154 aa  168  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
161 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  56.94 
 
 
172 aa  168  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  60 
 
 
156 aa  168  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  52.6 
 
 
157 aa  167  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  55.56 
 
 
153 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  53.79 
 
 
150 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  54.17 
 
 
154 aa  165  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  61.9 
 
 
154 aa  164  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  52 
 
 
160 aa  163  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  52.05 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  53.38 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
152 aa  161  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  52.7 
 
 
159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
158 aa  160  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  48.37 
 
 
154 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
162 aa  159  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  49.67 
 
 
155 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20300  SsrA-binding protein  53.47 
 
 
168 aa  159  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  51.95 
 
 
155 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
152 aa  158  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  55.56 
 
 
150 aa  157  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  55.56 
 
 
150 aa  157  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
165 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  50.69 
 
 
159 aa  156  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  57.97 
 
 
153 aa  156  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  54.55 
 
 
164 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  54.29 
 
 
161 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  53.24 
 
 
167 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
161 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  54.55 
 
 
164 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  51.63 
 
 
159 aa  154  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  51.97 
 
 
157 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  54.55 
 
 
155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  50 
 
 
162 aa  153  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  49.34 
 
 
154 aa  153  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  53.15 
 
 
164 aa  153  9e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  52.74 
 
 
167 aa  153  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  49.68 
 
 
158 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  50 
 
 
156 aa  152  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  51.72 
 
 
177 aa  152  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
154 aa  152  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  47.06 
 
 
159 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  49.02 
 
 
156 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  49.34 
 
 
155 aa  152  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  47.13 
 
 
176 aa  151  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
155 aa  150  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  52.05 
 
 
165 aa  150  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  48.67 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  46.67 
 
 
154 aa  150  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  150  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  47.02 
 
 
177 aa  150  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  46.1 
 
 
153 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  50 
 
 
159 aa  149  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
161 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  50.64 
 
 
157 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0948548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>