More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1916 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  100 
 
 		 165 aa  340  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  93.33 
 
 		 165 aa  323  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  90.45 
 
 		 168 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  90.45 
 
 		 168 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  90.45 
 
 		 168 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  82.78 
 
 		 160 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  78.71 
 
 		 157 aa  257  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  73.55 
 
 		 159 aa  252  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  66.88 
 
 		 160 aa  231  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  65.16 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  65.58 
 
 		 158 aa  222  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  67.53 
 
 		 159 aa  220  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  65.16 
 
 		 159 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  63.87 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  61.69 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  59.88 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  62.18 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  61.64 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  59.87 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  63.64 
 
 		 158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  58.78 
 
 		 160 aa  193  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  58.28 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  56.77 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  58.11 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  60.43 
 
 		 161 aa  187  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  57.62 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  55.97 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  53.9 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  54.14 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  56.29 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2662  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0252069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  57.05 
 
 		 155 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  54.36 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  50.32 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 152 aa  166  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  60.61 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  56.83 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  54.78 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2397  SsrA-binding protein  58.04 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.013671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  53.59 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 155 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  52.94 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  52.94 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 155 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  51.55 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  51.92 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 157 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  52 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  49.35 
 
 		 157 aa  160  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  54.93 
 
 		 157 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.14 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  49.04 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.14 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  54.17 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  158  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 155 aa  158  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  50 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  50.94 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  46.84 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  50 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 147 aa  157  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.68 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20300  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  51.95 
 
 		 171 aa  154  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  51.32 
 
 		 155 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  154  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>