More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0748 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  322  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  64.52 
 
 		 155 aa  214  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  66.45 
 
 		 155 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  66.45 
 
 		 155 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  65.16 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 155 aa  210  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  62.75 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  64.52 
 
 		 155 aa  207  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  62.18 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  63.87 
 
 		 161 aa  204  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  64.86 
 
 		 154 aa  204  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  63.23 
 
 		 155 aa  204  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  63.4 
 
 		 158 aa  204  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  62.84 
 
 		 150 aa  203  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  60.67 
 
 		 155 aa  200  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  60.96 
 
 		 153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  61.07 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  61.94 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  56.95 
 
 		 154 aa  192  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  58.11 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  60.51 
 
 		 158 aa  190  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  58.39 
 
 		 152 aa  189  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  56.49 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  59.62 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  54.9 
 
 		 154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  55.33 
 
 		 153 aa  187  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  62.24 
 
 		 157 aa  186  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  59.24 
 
 		 158 aa  186  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  57.62 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  56.67 
 
 		 152 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  58.39 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  57.05 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  58.17 
 
 		 154 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  58.17 
 
 		 154 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  67.19 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  54.61 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  58.28 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 152 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  54.19 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  54.19 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  57.52 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  54.36 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  59.18 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  56.13 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  55.13 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  53.29 
 
 		 154 aa  174  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 154 aa  174  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  54.97 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  56.29 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  55.13 
 
 		 159 aa  173  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  53.95 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 155 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  53.55 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  56.55 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  53.29 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  55.71 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  54.49 
 
 		 158 aa  169  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  54.67 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  52.67 
 
 		 160 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  54.36 
 
 		 161 aa  167  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  53.55 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 157 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  51.61 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  54.67 
 
 		 157 aa  166  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  54 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  52.98 
 
 		 171 aa  165  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  56.08 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  54 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  52.56 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  54 
 
 		 157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  52.29 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  52.67 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  51.39 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  50 
 
 		 182 aa  160  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  50 
 
 		 172 aa  160  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 165 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  53.02 
 
 		 155 aa  159  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  59.69 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>