More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1092 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  100 
 
 
152 aa  303  8.000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  56.67 
 
 
161 aa  190  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  60.54 
 
 
159 aa  190  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  59.86 
 
 
157 aa  186  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  55.33 
 
 
150 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  57.72 
 
 
155 aa  183  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  183  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  58.33 
 
 
155 aa  183  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  58.28 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  57.62 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
153 aa  181  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  53.47 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  52.7 
 
 
157 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  56.95 
 
 
151 aa  180  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  61.38 
 
 
150 aa  180  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  61.38 
 
 
150 aa  180  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  58.5 
 
 
151 aa  180  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  56.08 
 
 
159 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  56.38 
 
 
155 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  56.38 
 
 
152 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  57.05 
 
 
155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  56.38 
 
 
155 aa  177  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  55.7 
 
 
155 aa  174  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  53.33 
 
 
158 aa  173  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1018  SsrA-binding protein  58.9 
 
 
158 aa  173  9e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  54.11 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  58.9 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.38 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  49.67 
 
 
152 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  49.33 
 
 
161 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  53.06 
 
 
155 aa  167  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  52.67 
 
 
155 aa  167  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
156 aa  167  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  49.33 
 
 
165 aa  166  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  54.79 
 
 
155 aa  166  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  53.15 
 
 
159 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  52.05 
 
 
157 aa  165  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
158 aa  165  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  56.94 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  48.98 
 
 
165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  54.61 
 
 
161 aa  164  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
162 aa  164  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  53.47 
 
 
161 aa  164  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  52.35 
 
 
157 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  51.39 
 
 
154 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  52.7 
 
 
160 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  52 
 
 
154 aa  163  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  52.41 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  52.7 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  54.17 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  51.02 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  52.7 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  51.35 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
154 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  51.35 
 
 
172 aa  161  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  51.35 
 
 
156 aa  161  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
154 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  48.59 
 
 
160 aa  161  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  50.36 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  53.79 
 
 
149 aa  160  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  55.17 
 
 
177 aa  160  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  52.74 
 
 
154 aa  158  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  53.38 
 
 
159 aa  158  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  58.02 
 
 
153 aa  158  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
159 aa  157  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  51.06 
 
 
165 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
160 aa  157  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
155 aa  157  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  53.06 
 
 
154 aa  157  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  56.94 
 
 
150 aa  157  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  51.8 
 
 
163 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  52.45 
 
 
154 aa  157  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
157 aa  156  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  52.45 
 
 
155 aa  156  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  47.95 
 
 
157 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  50.36 
 
 
163 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  50.36 
 
 
163 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  51.72 
 
 
150 aa  156  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  52.82 
 
 
159 aa  155  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6841  SsrA-binding protein  51.39 
 
 
162 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255354  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  48.59 
 
 
171 aa  154  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0524  SsrA-binding protein  53.38 
 
 
157 aa  154  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00169636  normal  0.364367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  51.72 
 
 
147 aa  154  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  51.41 
 
 
159 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  47.62 
 
 
159 aa  154  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  48.94 
 
 
167 aa  154  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.61 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>