More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2954 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  100 
 
 		 155 aa  312  8e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  96.13 
 
 		 155 aa  303  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  77.42 
 
 		 155 aa  262  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  76.77 
 
 		 155 aa  255  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  76.77 
 
 		 155 aa  255  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  75.48 
 
 		 155 aa  253  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  75.48 
 
 		 155 aa  253  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  75.48 
 
 		 155 aa  253  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  75.48 
 
 		 155 aa  253  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  75.48 
 
 		 155 aa  253  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  75.48 
 
 		 155 aa  252  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  74.19 
 
 		 155 aa  249  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  73.55 
 
 		 155 aa  249  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  71.9 
 
 		 156 aa  228  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  70.27 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  64.52 
 
 		 157 aa  214  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  67.55 
 
 		 154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  64.19 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  65.54 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  62.5 
 
 		 154 aa  204  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  65.07 
 
 		 150 aa  202  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  63.51 
 
 		 153 aa  201  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  63.51 
 
 		 151 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  61.33 
 
 		 153 aa  200  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  62.16 
 
 		 152 aa  200  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  66.21 
 
 		 158 aa  200  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  62.67 
 
 		 155 aa  199  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  64.58 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  65.03 
 
 		 157 aa  198  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  61.59 
 
 		 154 aa  198  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  64.58 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  64.58 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  62 
 
 		 155 aa  196  9e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  60.4 
 
 		 151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  61.49 
 
 		 152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  57.96 
 
 		 158 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  62.84 
 
 		 159 aa  193  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  64.38 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  62.84 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  57.33 
 
 		 154 aa  190  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  58 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  58 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  59.06 
 
 		 158 aa  189  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  58.5 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  60.54 
 
 		 161 aa  187  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  57.42 
 
 		 159 aa  187  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  57.33 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  57.42 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  59.21 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  60 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 154 aa  183  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  60.69 
 
 		 154 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  59.33 
 
 		 158 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  60 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  59.59 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  54.9 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  59.46 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  56.38 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 150 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  58.11 
 
 		 155 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 159 aa  176  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  57.82 
 
 		 157 aa  176  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  58.94 
 
 		 155 aa  175  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  57.75 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  59.31 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  54.23 
 
 		 162 aa  173  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  59.44 
 
 		 148 aa  173  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  53.55 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  54.25 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  59.03 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  54.86 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  59.29 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  59.29 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  54 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  56 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  54.3 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  60.9 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  52.9 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  57.45 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  54.19 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  55 
 
 		 149 aa  164  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 165 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  50 
 
 		 156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 165 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  57.86 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  52.41 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 149 aa  160  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>