More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0947 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  100 
 
 		 161 aa  323  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  78.98 
 
 		 160 aa  252  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  73.08 
 
 		 159 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  73.72 
 
 		 159 aa  242  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  70.51 
 
 		 157 aa  237  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  71.34 
 
 		 158 aa  234  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  69.87 
 
 		 159 aa  230  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  67.52 
 
 		 159 aa  230  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  67.92 
 
 		 159 aa  227  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  69.23 
 
 		 159 aa  223  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  65.16 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 168 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 168 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 168 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  65.81 
 
 		 165 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  63.98 
 
 		 162 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  65.1 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 159 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 160 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  68.79 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  62.91 
 
 		 160 aa  210  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  63.12 
 
 		 160 aa  208  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  66.44 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  64.47 
 
 		 167 aa  207  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  65.1 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  70 
 
 		 161 aa  204  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  64.75 
 
 		 167 aa  194  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  62.24 
 
 		 153 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  61.07 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  63.38 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  61.7 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  60.56 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  59.59 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  60.28 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  58.33 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  59.03 
 
 		 172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  58.45 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  58.87 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  57.82 
 
 		 161 aa  176  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  58.45 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  58.45 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  58.45 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  58.45 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  58.45 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  57.75 
 
 		 155 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  58.45 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  58.45 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  57.75 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  58 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  58.45 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  56.25 
 
 		 153 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  57.45 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 154 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  56.03 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  54.9 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  54.36 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  60.43 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  57.75 
 
 		 157 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 156 aa  167  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2662  SsrA-binding protein  58.62 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0252069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  54.86 
 
 		 151 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20300  SsrA-binding protein  57.45 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  56.74 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  56.08 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  56.85 
 
 		 155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  54.05 
 
 		 155 aa  164  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2397  SsrA-binding protein  57.93 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.013671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  55 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  54.05 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 157 aa  160  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  51.95 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  50.64 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  51.28 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 158 aa  157  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07630  SsrA-binding protein  56.64 
 
 		 171 aa  153  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>