More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_07630 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_07630  SsrA-binding protein  100 
 
 
171 aa  353  7.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2662  SsrA-binding protein  71.43 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0252069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  68.03 
 
 
177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2397  SsrA-binding protein  73.97 
 
 
158 aa  209  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.013671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  65.13 
 
 
156 aa  205  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  65.75 
 
 
167 aa  200  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  58.39 
 
 
176 aa  200  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  61.59 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  62.59 
 
 
154 aa  197  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  62.42 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  57.23 
 
 
167 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  63.7 
 
 
160 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  59.35 
 
 
177 aa  193  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  61.18 
 
 
159 aa  191  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  61.07 
 
 
159 aa  191  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  60 
 
 
165 aa  189  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  59.73 
 
 
158 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  57.79 
 
 
155 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  61.22 
 
 
158 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  59.73 
 
 
160 aa  185  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  61.81 
 
 
159 aa  185  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20300  SsrA-binding protein  57.82 
 
 
168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  56.49 
 
 
162 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  59.59 
 
 
159 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  60.28 
 
 
161 aa  177  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  56.38 
 
 
157 aa  177  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  56.64 
 
 
161 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  56.49 
 
 
159 aa  175  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  55.84 
 
 
159 aa  174  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  56.64 
 
 
165 aa  174  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  57.34 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  55.56 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  57.34 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  57.34 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  63.09 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
165 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  54.17 
 
 
160 aa  168  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  51.37 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
153 aa  153  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  51.7 
 
 
150 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  46.75 
 
 
157 aa  149  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  52 
 
 
151 aa  149  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  47.92 
 
 
152 aa  147  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  49.01 
 
 
155 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  46.36 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.02 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  46.36 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  46.71 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
153 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  46.62 
 
 
153 aa  144  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  47.97 
 
 
172 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  46.36 
 
 
155 aa  144  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  45.7 
 
 
155 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
151 aa  143  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  45.7 
 
 
155 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  45.7 
 
 
155 aa  143  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  45.7 
 
 
155 aa  143  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  48 
 
 
159 aa  143  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  45.7 
 
 
155 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  46.71 
 
 
155 aa  143  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  46 
 
 
155 aa  143  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
157 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  45.7 
 
 
155 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  47.68 
 
 
155 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0348  SsrA-binding protein  47.89 
 
 
151 aa  141  4e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  46.54 
 
 
158 aa  141  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  47.71 
 
 
158 aa  141  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
150 aa  141  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
150 aa  141  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  47.97 
 
 
152 aa  141  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  47.26 
 
 
158 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  47.95 
 
 
150 aa  141  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  46.54 
 
 
158 aa  141  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  45.45 
 
 
156 aa  141  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  46.1 
 
 
156 aa  140  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  48.28 
 
 
155 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  47.3 
 
 
157 aa  140  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  47.2 
 
 
165 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  46.45 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  47.65 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  46.45 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  44.37 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  42.86 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  44.37 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  47.59 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  47.59 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  46.31 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  46.9 
 
 
155 aa  138  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  46.05 
 
 
155 aa  138  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  46.21 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  42.57 
 
 
154 aa  137  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  46.98 
 
 
158 aa  137  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  44.67 
 
 
155 aa  136  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  45.07 
 
 
162 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  46.94 
 
 
154 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  44.59 
 
 
158 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  43.62 
 
 
155 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  46.9 
 
 
147 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>