More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3832 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  68.55 
 
 		 158 aa  228  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  69.62 
 
 		 158 aa  226  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  64.74 
 
 		 157 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  63.92 
 
 		 158 aa  216  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  63.92 
 
 		 158 aa  216  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  64.1 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  64.94 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  65.58 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  67.57 
 
 		 159 aa  214  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  64.74 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  65.19 
 
 		 165 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  64.74 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  63.29 
 
 		 158 aa  212  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  64.94 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  66.89 
 
 		 159 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  68.28 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  69.23 
 
 		 157 aa  207  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  66.44 
 
 		 161 aa  206  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  69.87 
 
 		 157 aa  205  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  68.59 
 
 		 157 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  67.95 
 
 		 157 aa  204  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  65.1 
 
 		 160 aa  201  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 157 aa  200  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 157 aa  200  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  62.42 
 
 		 160 aa  200  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  60.76 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  63.01 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  63.52 
 
 		 159 aa  196  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  61.22 
 
 		 160 aa  191  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  62.42 
 
 		 152 aa  180  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  53.16 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  53.59 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  53.59 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  53.64 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  50.96 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  55.35 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 159 aa  163  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  54.35 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  54.35 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  50 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  51.97 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  52 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  57.36 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  52.32 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  47.77 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  52.26 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  51.63 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  51.11 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  50 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  48.03 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  47.77 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  50 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  49.67 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  50.64 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  50 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  46.5 
 
 		 156 aa  140  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  49.63 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  47.13 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  52.63 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  47.44 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>