More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0847 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  100 
 
 		 158 aa  320  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  85.35 
 
 		 158 aa  281  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  72.15 
 
 		 157 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  70.25 
 
 		 157 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  69.62 
 
 		 157 aa  229  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  70.25 
 
 		 157 aa  229  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  69.62 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  68.55 
 
 		 158 aa  228  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  68.35 
 
 		 157 aa  225  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  67.72 
 
 		 157 aa  224  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  66.03 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  66.88 
 
 		 159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  65.62 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  66.03 
 
 		 158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  66.03 
 
 		 158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  66.24 
 
 		 158 aa  213  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  64.43 
 
 		 165 aa  211  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  63.76 
 
 		 160 aa  206  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  64.43 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  64.15 
 
 		 158 aa  201  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  63.51 
 
 		 155 aa  199  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  63.75 
 
 		 159 aa  198  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  63.92 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  63.92 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  64.56 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  63.92 
 
 		 157 aa  193  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  61.74 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  62.66 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  63.51 
 
 		 152 aa  185  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  61.39 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  57.05 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  60.26 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 160 aa  176  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  56.41 
 
 		 157 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  56.41 
 
 		 157 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  56 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  56.08 
 
 		 155 aa  167  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  52.98 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  53.69 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  54.23 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  54.23 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  57.82 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  49.34 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  54.49 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  52.98 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 152 aa  150  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  50 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  48.45 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  50.64 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  55.04 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  45.86 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  48.03 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  53.19 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  50 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  49.04 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  49.68 
 
 		 157 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  49.36 
 
 		 155 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  52 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1702  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  52 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  49.68 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  52 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  49.02 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1901  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.673502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  50 
 
 		 172 aa  140  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2435  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.0945366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  49.04 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  49.67 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  47.79 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1616  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.823656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>