More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3476 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  100 
 
 		 150 aa  303  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  55.1 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 157 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 158 aa  153  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 159 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 155 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  53.62 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 172 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1861  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706787  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  53.19 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  50 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  57.81 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 159 aa  141  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3370  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0666937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1456  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2032  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.17643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1303  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2049  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1702  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3280  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.234096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>