More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3085 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  100 
 
 		 152 aa  310  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  66.44 
 
 		 157 aa  200  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  67.12 
 
 		 157 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  66.44 
 
 		 157 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  66.44 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  65.31 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  63.7 
 
 		 157 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  65.07 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  65.73 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  64.38 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  61.07 
 
 		 158 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  61.74 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  59.06 
 
 		 160 aa  187  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  63.51 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  61.74 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  62.42 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  61.07 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 158 aa  183  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  59.31 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  61.49 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  60.54 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  62.42 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  62.59 
 
 		 158 aa  179  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  60 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  60.96 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  60 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  63.95 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  57.93 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  63.27 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  63.95 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  63.95 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 160 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  62.59 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  62.25 
 
 		 159 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  61.22 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  57.82 
 
 		 165 aa  167  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  55.1 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  56.85 
 
 		 157 aa  153  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  54.05 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  54.86 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 149 aa  149  8.999999999999999e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 152 aa  147  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  53.96 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  55.48 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 152 aa  146  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  55.1 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1485  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01177  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 155 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 172 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1301  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.928696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  54.69 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  53.24 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2435  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.0945366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1702  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 158 aa  140  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  53.1 
 
 		 155 aa  140  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1456  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1590  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 167 aa  140  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>