More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1318 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  100 
 
 		 148 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2435  SsrA-binding protein  92.57 
 
 		 148 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.0945366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1702  SsrA-binding protein  92.52 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2049  SsrA-binding protein  88.51 
 
 		 148 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1303  SsrA-binding protein  87.84 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1532  SsrA-binding protein  87.84 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2558  SsrA-binding protein  87.84 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2412  SsrA-binding protein  87.84 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3280  SsrA-binding protein  87.84 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.234096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2467  SsrA-binding protein  87.84 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.838466  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2032  SsrA-binding protein  87.84 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.17643  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6078  SsrA-binding protein  87.16 
 
 		 148 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2019  SsrA-binding protein  87.16 
 
 		 148 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1999  SsrA-binding protein  87.16 
 
 		 148 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1901  SsrA-binding protein  86.49 
 
 		 148 aa  264  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.673502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1277  SsrA-binding protein  87.67 
 
 		 148 aa  262  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.622701 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2032  SsrA-binding protein  86.49 
 
 		 148 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.148914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5309  SsrA-binding protein  85.81 
 
 		 148 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0732663  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  81.38 
 
 		 148 aa  244  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  81.38 
 
 		 148 aa  243  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1301  SsrA-binding protein  80.69 
 
 		 148 aa  243  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.928696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1861  SsrA-binding protein  76.55 
 
 		 150 aa  236  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1456  SsrA-binding protein  77.93 
 
 		 150 aa  236  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1203  SsrA-binding protein  71.03 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1756  SsrA-binding protein  69.86 
 
 		 149 aa  215  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.941289  normal  0.680146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  70.55 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1426  SsrA-binding protein  68.97 
 
 		 150 aa  208  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1616  SsrA-binding protein  65.52 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.823656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  64.58 
 
 		 157 aa  201  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1145  SsrA-binding protein  62.76 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.533821  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0526  SsrA-binding protein  66.21 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.867775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  66.9 
 
 		 149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2057  SsrA-binding protein  62.07 
 
 		 154 aa  193  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00464392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2436  SsrA-binding protein  59.59 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  57.64 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  57.64 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2757  SsrA-binding protein  60.42 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2005  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 185 aa  184  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0231332  normal  0.713632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2546  SsrA-binding protein  62.5 
 
 		 157 aa  184  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  61.81 
 
 		 157 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2552  SsrA-binding protein  61.11 
 
 		 157 aa  183  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1256  SsrA-binding protein  61.11 
 
 		 157 aa  183  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0547561  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3374  SsrA-binding protein  61.81 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  58.33 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3370  SsrA-binding protein  57.64 
 
 		 160 aa  181  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0666937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1198  SsrA-binding protein  60.42 
 
 		 189 aa  180  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 159 aa  179  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 159 aa  177  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1393  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00517715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  54.86 
 
 		 157 aa  177  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3004  SsrA-binding protein  56.94 
 
 		 173 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.034117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  56.64 
 
 		 160 aa  173  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3903  SsrA-binding protein  56.94 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5488  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63060  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2005  SsrA-binding protein  57.86 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1485  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43050  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.490843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1530  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0358  SsrA-binding protein  55.71 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3632  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.865786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0325  SsrA-binding protein  55.71 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  57.34 
 
 		 155 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2898  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2751  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1590  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01177  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1463  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 167 aa  156  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0677616  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1520  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3690  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0581968  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4515  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4203  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2388  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 160 aa  151  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  51.77 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2741  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 162 aa  151  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0724  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0959  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0755  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 160 aa  150  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609664  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 155 aa  150  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02508  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1055  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2772  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.114696  normal  0.13195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3860  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0583942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2778  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000718154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3009  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117126  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2904  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.386686  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02472  hypothetical protein  47.26 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1064  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356681  normal  0.744572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01809  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00252244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3972  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.437148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2980  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.634619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1372  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000169274  normal  0.0258325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>