More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1582 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  100 
 
 
156 aa  320  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  66.44 
 
 
152 aa  196  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  60.96 
 
 
159 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  62.94 
 
 
158 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  60.27 
 
 
159 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  60.26 
 
 
158 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  61.38 
 
 
158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  55.7 
 
 
158 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  58.22 
 
 
158 aa  177  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  55.06 
 
 
158 aa  177  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  56.29 
 
 
155 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
160 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  55.7 
 
 
158 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
157 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  55.35 
 
 
158 aa  170  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
161 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  56.16 
 
 
157 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  55.92 
 
 
157 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  55.92 
 
 
157 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  52.05 
 
 
160 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  56.16 
 
 
157 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
158 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  57.53 
 
 
157 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  53.5 
 
 
160 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  54.79 
 
 
157 aa  164  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  58.9 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  54.79 
 
 
157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  58.04 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  56.46 
 
 
160 aa  160  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  53.74 
 
 
165 aa  158  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  54.17 
 
 
149 aa  157  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  55.19 
 
 
157 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  51.61 
 
 
157 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  47.14 
 
 
147 aa  149  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  50.97 
 
 
157 aa  146  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  50 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  50 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  50 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
150 aa  144  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
150 aa  144  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  49.35 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  49.35 
 
 
157 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
155 aa  144  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  52.29 
 
 
160 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  51.88 
 
 
153 aa  141  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
150 aa  140  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  46.94 
 
 
155 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  49.69 
 
 
158 aa  140  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  50 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  49.31 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  48.97 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
156 aa  138  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  47.13 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  48.05 
 
 
155 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  48.68 
 
 
162 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
161 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  48.05 
 
 
155 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  45.16 
 
 
155 aa  137  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  49.02 
 
 
155 aa  137  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  45.89 
 
 
159 aa  136  8.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3690  SsrA-binding protein  48.73 
 
 
160 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0581968  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
159 aa  135  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
151 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  43.71 
 
 
155 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  43.71 
 
 
155 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  43.71 
 
 
155 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  44.9 
 
 
155 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  43.71 
 
 
155 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  43.71 
 
 
155 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0473  SsrA-binding protein  49.68 
 
 
160 aa  134  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  44.06 
 
 
149 aa  134  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  44.52 
 
 
156 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  43.71 
 
 
155 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3972  SsrA-binding protein  44.3 
 
 
159 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.437148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  42.38 
 
 
155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  43.71 
 
 
155 aa  133  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  46.79 
 
 
155 aa  133  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  48.92 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  43.05 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  43.05 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  48.91 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  48.92 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  49.64 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  49.29 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  46.79 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2833  SsrA-binding protein  46.88 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  46.62 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2883  SsrA-binding protein  46.88 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.195745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3015  SsrA-binding protein  46.88 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2901  SsrA-binding protein  46.88 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2903  SsrA-binding protein  46.88 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.70343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1485  SsrA-binding protein  47.68 
 
 
165 aa  131  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  48.61 
 
 
160 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  46.94 
 
 
150 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>