More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2134 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  68.46 
 
 		 152 aa  215  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  60.67 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3443  SsrA-binding protein  67.35 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 153 aa  174  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  150  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 159 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0569  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909805  normal  0.26821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  43.92 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 160 aa  135  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1552  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.350256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1162  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0862  SsrA-binding protein  46 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0707  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  46.27 
 
 		 153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  43.36 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  41.84 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  44.12 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  50.72 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  42.75 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  43.97 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  44.85 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  43.48 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  43.26 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2719  SsrA-binding protein  41.61 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.505154  normal  0.650431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  43.48 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  43.48 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  43.48 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  47.01 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4169  SsrA-binding protein  40.85 
 
 		 160 aa  123  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.496394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.79 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  40.67 
 
 		 172 aa  122  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  41.89 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  42.75 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  43.36 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>