More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0707 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0707  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  75.8 
 
 		 157 aa  252  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  71.97 
 
 		 157 aa  236  6.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  71.34 
 
 		 157 aa  230  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0862  SsrA-binding protein  68.79 
 
 		 157 aa  223  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0569  SsrA-binding protein  69.43 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909805  normal  0.26821 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1162  SsrA-binding protein  67.52 
 
 		 157 aa  217  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  55.32 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.97 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  55.47 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  51.82 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  53.28 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  54.01 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  53.28 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  51.09 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  47.06 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  51.82 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  49.02 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  46.84 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 172 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  46.05 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  48.91 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  49.63 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  50.37 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  51.11 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  46.32 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  46.32 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  48.37 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  50.72 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  48.53 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  48.91 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  41.94 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  43.67 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  47.79 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  43.88 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  45.75 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.91 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  45.51 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  43.48 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  50.72 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 152 aa  131  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  50.39 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  43.79 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0524  SsrA-binding protein  46.05 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00169636  normal  0.364367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  52.17 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>