More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0862 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0862  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  314  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1162  SsrA-binding protein  77.92 
 
 		 157 aa  249  9.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  71.97 
 
 		 157 aa  242  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  71.34 
 
 		 157 aa  239  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0569  SsrA-binding protein  70.06 
 
 		 157 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909805  normal  0.26821 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0707  SsrA-binding protein  68.79 
 
 		 157 aa  223  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  64.97 
 
 		 157 aa  209  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  48.73 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  46.41 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  53.28 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  45.96 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  45.1 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  49.26 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  51.59 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  44.6 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  134  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  49.01 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  49.63 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  46 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  43.95 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  45.65 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  46.41 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  44.94 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  49.26 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  44.6 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  44.81 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  45.91 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46.76 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  45.59 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  43.17 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  44.12 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  46.32 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1272  SsrA-binding protein  39.49 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  44.3 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  42.45 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  44.3 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  42.04 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  45.65 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  44.3 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  43.04 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  45.19 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  44.85 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>