More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0710 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  100 
 
 		 144 aa  282  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  61.43 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  54.17 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  55.1 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 157 aa  146  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  50 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 172 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2719  SsrA-binding protein  44.12 
 
 		 158 aa  136  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.505154  normal  0.650431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 162 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0862  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0033  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 150 aa  131  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  42.66 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  40.85 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 162 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  43.26 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  41.96 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  41.84 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  44.03 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1162  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  41.96 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  50.38 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  41.55 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  43.26 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0569  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909805  normal  0.26821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  46.92 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  46.92 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 154 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  50.72 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  40 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>