More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1725 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  100 
 
 		 154 aa  312  9e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  62.84 
 
 		 151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  61.69 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  57.05 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 155 aa  183  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  60 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  58.39 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 155 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 155 aa  176  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 155 aa  176  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  57.04 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  58.62 
 
 		 154 aa  174  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  53.02 
 
 		 155 aa  173  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  54.25 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  53.95 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  54.9 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  54.9 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 155 aa  167  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  52.94 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  51.63 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  51.63 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  50.65 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.33 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  52.32 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 156 aa  156  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  52.52 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  47.77 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  52.67 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  49.01 
 
 		 157 aa  150  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 157 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 164 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  47.06 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  49.65 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  45.57 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  48.03 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  45.16 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  47.44 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 172 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl210  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.021632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  53.49 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0033  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>