More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl210 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl210  SsrA-binding protein  100 
 
 		 149 aa  291  3e-78  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.021632  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0096  SsrA-binding protein  64.86 
 
 		 148 aa  201  3e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 156 aa  140  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0524  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00169636  normal  0.364367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  50.74 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  48.51 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  45.33 
 
 		 172 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  42.66 
 
 		 168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  42.66 
 
 		 168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  42.66 
 
 		 168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  44.67 
 
 		 182 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 172 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 159 aa  126  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 150 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 150 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  48.32 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  47.48 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  41.96 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  46 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  48.53 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3690  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 160 aa  124  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0581968  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02508  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1055  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2772  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.114696  normal  0.13195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1064  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356681  normal  0.744572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2778  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000718154  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2904  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.386686  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3860  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0583942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3009  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02472  hypothetical protein  45.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  48.53 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1485  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  43.92 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 158 aa  120  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0065  SsrA-binding protein  46.76 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.986546  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0358  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3370  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0666937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0325  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2467  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.838466  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1532  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2558  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3280  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.234096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2032  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.17643  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2049  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1303  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840826  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>