More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01921 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  100 
 
 		 165 aa  331  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  83.13 
 
 		 167 aa  271  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  83.78 
 
 		 166 aa  259  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  79.22 
 
 		 166 aa  254  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  64.24 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  68.46 
 
 		 165 aa  220  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  61.59 
 
 		 164 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  59.15 
 
 		 164 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  61.84 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  58.54 
 
 		 164 aa  207  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  64.43 
 
 		 165 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  61.22 
 
 		 155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  58.5 
 
 		 155 aa  191  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  59.18 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  59.18 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  55.26 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  55.63 
 
 		 157 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  54.17 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 155 aa  160  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 155 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  49.68 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 151 aa  151  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  49.34 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  46.41 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  46.71 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  48.41 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  51.33 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  46 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  49.01 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 155 aa  147  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 155 aa  147  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  147  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  48.68 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  47.88 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.37 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46.41 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  51.06 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  46.76 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 153 aa  141  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  49.23 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 161 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  46.63 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  50 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  46.05 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  48.32 
 
 		 155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  46.05 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  51.94 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1239  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1094  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.146996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1272  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  44.08 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>