More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2153 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  100 
 
 
154 aa  314  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  81.17 
 
 
153 aa  253  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  66.89 
 
 
155 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  67.76 
 
 
151 aa  208  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  62.09 
 
 
154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  59.86 
 
 
151 aa  184  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  53.55 
 
 
155 aa  173  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  52.9 
 
 
155 aa  173  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  52.26 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  53.64 
 
 
157 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  51.63 
 
 
161 aa  167  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  49.36 
 
 
156 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  48.39 
 
 
155 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  48.39 
 
 
155 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
158 aa  157  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  51.35 
 
 
154 aa  155  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  50.7 
 
 
154 aa  156  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  53.15 
 
 
158 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  54.23 
 
 
151 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  53.15 
 
 
158 aa  154  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
156 aa  154  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.03 
 
 
150 aa  154  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.03 
 
 
150 aa  154  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  52.31 
 
 
154 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  48.68 
 
 
157 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  52.17 
 
 
151 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  47.33 
 
 
160 aa  147  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  47.26 
 
 
157 aa  147  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  49.33 
 
 
159 aa  147  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  47.02 
 
 
154 aa  147  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  48.97 
 
 
172 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  146  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  45.58 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3370  SsrA-binding protein  49.67 
 
 
160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0666937  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  48.37 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  48.37 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  48.3 
 
 
152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  48.7 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  48.28 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
155 aa  144  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1393  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  48.59 
 
 
155 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.28 
 
 
153 aa  144  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  46.62 
 
 
157 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  51.37 
 
 
148 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
159 aa  144  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  50.72 
 
 
161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  46.71 
 
 
156 aa  143  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  45.45 
 
 
176 aa  143  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  49.65 
 
 
152 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  47.97 
 
 
161 aa  142  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  47.92 
 
 
168 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
165 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
162 aa  142  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  47.92 
 
 
168 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  46.85 
 
 
177 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  47.92 
 
 
168 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  48.97 
 
 
152 aa  142  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  45.77 
 
 
154 aa  143  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  45.33 
 
 
159 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  47.62 
 
 
159 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  43.79 
 
 
164 aa  141  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  47.62 
 
 
159 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  45.7 
 
 
157 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  50 
 
 
157 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  50 
 
 
158 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  49.31 
 
 
149 aa  141  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  44.44 
 
 
164 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  46.98 
 
 
158 aa  141  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  49.67 
 
 
159 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
165 aa  140  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  46.31 
 
 
156 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  51.09 
 
 
147 aa  140  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  45.83 
 
 
165 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1576  SsrA-binding protein  48.97 
 
 
152 aa  140  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  44.37 
 
 
167 aa  140  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  44.08 
 
 
167 aa  140  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1203  SsrA-binding protein  48.57 
 
 
147 aa  140  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  45.33 
 
 
157 aa  140  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  48.23 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  45.83 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  48 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  43.51 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  47.59 
 
 
155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  49.29 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  45.89 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  46.26 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  47.33 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  45.14 
 
 
164 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  42.86 
 
 
153 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
159 aa  138  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  45.7 
 
 
154 aa  138  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0724  SsrA-binding protein  49.02 
 
 
160 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  46.26 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  45.33 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  50 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  45.77 
 
 
156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>