More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17411 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  100 
 
 
166 aa  334  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  81.12 
 
 
165 aa  244  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  75.84 
 
 
167 aa  236  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  76.35 
 
 
166 aa  233  7e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  65.45 
 
 
165 aa  226  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  69.33 
 
 
165 aa  220  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  67.81 
 
 
165 aa  208  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  61.11 
 
 
164 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  60.49 
 
 
164 aa  200  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  57.93 
 
 
164 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  63.89 
 
 
154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  63.45 
 
 
155 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
155 aa  188  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  56.49 
 
 
155 aa  187  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
157 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  60 
 
 
155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  60 
 
 
155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  51.66 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
158 aa  161  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
158 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  54.23 
 
 
155 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
158 aa  158  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  52.11 
 
 
155 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  48.97 
 
 
153 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  48.65 
 
 
155 aa  150  8.999999999999999e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
151 aa  149  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.32 
 
 
157 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  52.74 
 
 
156 aa  149  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  47.1 
 
 
157 aa  149  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  49.67 
 
 
157 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
154 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  50.7 
 
 
155 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  53.62 
 
 
156 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  48.72 
 
 
158 aa  143  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  50.7 
 
 
155 aa  143  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  50.7 
 
 
155 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
154 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
154 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  49.31 
 
 
159 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  51.01 
 
 
160 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  50 
 
 
150 aa  141  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  47.3 
 
 
154 aa  141  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  48.63 
 
 
153 aa  141  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  141  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  48.61 
 
 
158 aa  141  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  47.26 
 
 
154 aa  141  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  53.28 
 
 
150 aa  140  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  52.55 
 
 
151 aa  140  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  140  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  140  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
160 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  51.41 
 
 
150 aa  140  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  45.39 
 
 
155 aa  140  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  47.27 
 
 
175 aa  140  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  51.45 
 
 
155 aa  140  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  46.71 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  43.14 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  48.34 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  49.65 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  50.72 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  49.28 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  49.3 
 
 
151 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  45.52 
 
 
155 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1239  SsrA-binding protein  47.68 
 
 
186 aa  137  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  46.9 
 
 
154 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  45.83 
 
 
159 aa  137  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1094  SsrA-binding protein  45.89 
 
 
162 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.146996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  47.89 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  47.92 
 
 
159 aa  137  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  50 
 
 
154 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  48.59 
 
 
172 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
156 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
156 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  47.89 
 
 
155 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  46.53 
 
 
160 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  49.64 
 
 
148 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
151 aa  136  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  44.59 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  49.3 
 
 
153 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  50.7 
 
 
154 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1282  SsrA-binding protein  46.36 
 
 
164 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0727299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  47.55 
 
 
155 aa  134  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  45.52 
 
 
155 aa  133  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  42.94 
 
 
171 aa  133  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  51.94 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2479  SsrA-binding protein  43.59 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0209136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  47.92 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  48.67 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  43.31 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  46.05 
 
 
161 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
155 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1520  SsrA-binding protein  45.58 
 
 
164 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0417834  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  43.92 
 
 
161 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1272  SsrA-binding protein  43.92 
 
 
161 aa  131  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  47.65 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1407  SsrA-binding protein  44.9 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>