More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1996 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 156 aa  164  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 161 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  54.61 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 160 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  50.99 
 
 		 154 aa  154  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  54.89 
 
 		 156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  52.52 
 
 		 155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  49.63 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  49.63 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  48.57 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  48.55 
 
 		 155 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 167 aa  148  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  47.37 
 
 		 155 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 155 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.68 
 
 		 157 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  53.17 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 155 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  48.37 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  51.88 
 
 		 157 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  45.51 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 158 aa  141  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  44.85 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  44.74 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  51.13 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  51.13 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  44.87 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1198  SsrA-binding protein  48.53 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3632  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 173 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.865786 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 154 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6841  SsrA-binding protein  44.72 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  45.81 
 
 		 157 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  45.33 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  48.55 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5488  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  47.48 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63060  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  46.05 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>