More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6841 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6841  SsrA-binding protein  100 
 
 		 162 aa  330  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  50 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  48.72 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  53.69 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  49.69 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  51.37 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.1 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  50 
 
 		 176 aa  147  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  47.17 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  48 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  46 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  46 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  46 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  46 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  46 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  50 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  50 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  46 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  46 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  47.06 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  45.33 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  140  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  44.03 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  42.76 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  51.11 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  47.53 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  44.72 
 
 		 175 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  44.76 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  48.32 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  42.24 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  47.4 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  47.4 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  43.15 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0348  SsrA-binding protein  42.36 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 150 aa  134  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  43.36 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  43.36 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  43.71 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  45.22 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>