More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3807 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  100 
 
 
165 aa  333  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  85.42 
 
 
163 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  84.03 
 
 
163 aa  258  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  84.03 
 
 
163 aa  258  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  52.6 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  52.32 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
152 aa  159  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  49.34 
 
 
156 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  51.68 
 
 
159 aa  158  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  46.41 
 
 
155 aa  154  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  52.67 
 
 
160 aa  154  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  50 
 
 
160 aa  153  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  52.74 
 
 
167 aa  153  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  47.37 
 
 
157 aa  153  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  49.09 
 
 
171 aa  153  9e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  46.58 
 
 
156 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  47.3 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  51.68 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  47.3 
 
 
155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  49.31 
 
 
154 aa  151  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  46.62 
 
 
155 aa  150  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  47.3 
 
 
155 aa  151  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  57.25 
 
 
154 aa  150  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  46.62 
 
 
155 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  50 
 
 
158 aa  150  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
160 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
159 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  51.06 
 
 
153 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  54.68 
 
 
160 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  49.28 
 
 
153 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  45.95 
 
 
155 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  45.95 
 
 
155 aa  148  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  45.95 
 
 
155 aa  148  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  48.72 
 
 
158 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  45.95 
 
 
155 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  45.95 
 
 
155 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  45.95 
 
 
155 aa  148  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  51.06 
 
 
162 aa  147  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  47.95 
 
 
154 aa  147  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
157 aa  147  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  47.97 
 
 
154 aa  147  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  46.36 
 
 
154 aa  147  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  46.36 
 
 
157 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  45.89 
 
 
155 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  48 
 
 
172 aa  147  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  48.68 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  47.97 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  45.27 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  44.59 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  45.27 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  44.22 
 
 
156 aa  145  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  45.83 
 
 
172 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  48.3 
 
 
151 aa  144  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  45.14 
 
 
182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  49.33 
 
 
162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.39 
 
 
153 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  48 
 
 
155 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  43.4 
 
 
161 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  48.32 
 
 
155 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  46.62 
 
 
152 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6841  SsrA-binding protein  48 
 
 
162 aa  143  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255354  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
158 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  47.97 
 
 
159 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  48.65 
 
 
165 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  47.26 
 
 
155 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  47.26 
 
 
155 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  44.67 
 
 
152 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1256  SsrA-binding protein  48.3 
 
 
157 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0547561  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  48.3 
 
 
159 aa  141  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2552  SsrA-binding protein  48.3 
 
 
157 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  47.97 
 
 
158 aa  141  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  47.97 
 
 
158 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  44.9 
 
 
155 aa  141  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
157 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2436  SsrA-binding protein  46.94 
 
 
149 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
157 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  53.9 
 
 
160 aa  140  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  47.95 
 
 
157 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  46.71 
 
 
161 aa  140  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  44.59 
 
 
156 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  44.59 
 
 
156 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  47.65 
 
 
156 aa  140  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
157 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2005  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
185 aa  140  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0231332  normal  0.713632 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  50 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  44.52 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  48 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  46.62 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  47.59 
 
 
165 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  47.3 
 
 
168 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  47.3 
 
 
168 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  47.3 
 
 
168 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3374  SsrA-binding protein  46.26 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  47.26 
 
 
150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  47.65 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  48.3 
 
 
154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  43.06 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  49.3 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>