More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2014 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  65.1 
 
 		 154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  60.42 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 154 aa  184  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  58.04 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  54.86 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  50 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  156  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 158 aa  151  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  52.48 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  50 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 154 aa  150  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  50 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  52.24 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 159 aa  146  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  46.94 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  51.85 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 177 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 158 aa  140  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 182 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 155 aa  139  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  52.21 
 
 		 158 aa  139  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  50 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  50.38 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  45.89 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  50 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  42.18 
 
 		 164 aa  136  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 163 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>