More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1501 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  61.29 
 
 		 154 aa  204  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  63.51 
 
 		 154 aa  203  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  62.84 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  58.67 
 
 		 155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  58.67 
 
 		 155 aa  194  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  60 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  58.82 
 
 		 155 aa  191  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  58 
 
 		 155 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  61.29 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  60.78 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  60.78 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  57.33 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  57.33 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  56.67 
 
 		 155 aa  186  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  56.67 
 
 		 155 aa  186  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  56.67 
 
 		 155 aa  186  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  56.67 
 
 		 155 aa  186  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  56.67 
 
 		 155 aa  186  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  58.11 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  58.82 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  56.76 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  54.19 
 
 		 157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 154 aa  174  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  54.36 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  52.26 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  54.05 
 
 		 157 aa  173  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  54.61 
 
 		 161 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  53.5 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  50.98 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 160 aa  171  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  54 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  53.64 
 
 		 154 aa  170  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 152 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  54.23 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 159 aa  167  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  52.6 
 
 		 155 aa  166  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  52.29 
 
 		 155 aa  166  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  54.05 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  60.31 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  51.97 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.26 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  51.63 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  49.02 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  51.97 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  50 
 
 		 162 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  53.69 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  53.69 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  47.74 
 
 		 159 aa  156  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45.1 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  49.69 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  50.98 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  52.52 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  50 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  46.45 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  45.81 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  49.32 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  49.34 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  50 
 
 		 182 aa  150  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 152 aa  150  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  47.06 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 155 aa  150  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  45.75 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  46.05 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  50 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>