More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5661 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  100 
 
 		 153 aa  311  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  74.17 
 
 		 152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  60.53 
 
 		 153 aa  198  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  57.45 
 
 		 156 aa  169  9e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  53.19 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  56.55 
 
 		 153 aa  166  9e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  56.52 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.21 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.21 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  53.24 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  51.09 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  52.9 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  52.9 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  51.66 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  55.3 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1552  SsrA-binding protein  53.19 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.350256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 165 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  52.9 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  50.72 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  52.9 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0569  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909805  normal  0.26821 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  52.17 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  49.26 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  51.09 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  51.09 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0707  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  52.17 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  50 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3443  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  47.68 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  43.84 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 165 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  48.91 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  48.91 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  42.47 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>