More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3663 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  100 
 
 		 145 aa  290  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  53.19 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  57.25 
 
 		 152 aa  168  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  53.24 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 152 aa  151  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  52.14 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  52.17 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 172 aa  143  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  50 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  47.86 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1552  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.350256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  45 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  46.32 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  47.48 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  42.14 
 
 		 176 aa  133  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  50.79 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 177 aa  132  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  40.43 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  44.2 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 155 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 155 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0033  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  47.52 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  44.2 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45 
 
 		 159 aa  130  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 177 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  41.13 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0707  SsrA-binding protein  43.48 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  41.84 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  43.17 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  43.17 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  43.17 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1272  SsrA-binding protein  43.26 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  42.66 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  41.3 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  42.45 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  42.14 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  41.84 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  45 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>